从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中提取基因组DNA是分子诊断的第一个关键步骤。蜡片中稳定的基因组DNA含量有利于衡量FFPE提取试剂盒的效率，及FFPE提取流程的精确性，重复性，稳定性。
菁良基因基于自身蜡块包埋高度均一性及稳定的生产工艺，在制作过程确保每个部分包含相同的细胞数量，生产出基因组DNA含量稳定的FFPE切片，是分析FFPE切片DNA提取效率的理想材料。
菁良基因在近期推出的“肿瘤SNV 5%FFPE标准品”中随机挑选了几个批次的FFPE切片产品，送给8家客户进行提取效率的验证。
每片产品中包埋的细胞数目大约是390,000个，基因组DNA含量大于400ng（采用推荐提取试剂盒）。
如下图所示，8家客户及菁良本身使用的共6种提取kit，分别从一片FFPE标准品中提取的gDNA含量分布。
（从FFPE切片中提取出基因组DNA含量分布）
说明
以上图标从左至右数据依次为：
左一：菁良基因使用Promega Maxwell LEV Plus FFPE DNA Extraction
kit从30片“肿瘤SNV 5%FFPE标准品”提取出来基因组DNA的平均值。
左二：客户A使用Life生产的“RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit(AM1975)”的提取结果。
左三、四、五、六：客户B、C、D、E分别使用凯杰生产的“QIAamp DNA FFPE Tissue Kit （56404）”提取试剂盒，提取量从200ng到800ng不等。
右三：客户F使用新百基生产的“石蜡包埋组织切片DNA提取试剂盒（M2015-01）”的提取结果。
右二：客户G使用艾德生物生产的“核酸提取试剂（型号：FFPE DNA）”的提取结果。
右一：客户H使用美基生物生产的“核酸提取或纯化试剂（IVD3101）”来进行提取。
从数据图中我们可以看出，即使其中有四家客户同时使用了凯杰生产的“QIAampDNA FFPE Tissue Kit （56404）”提取试剂盒，提取量也从200ng到800ng不等。
这表明由于提取过程引入的操作人员，操作流程，操作环境等各种因素的影响，目前市面上各公司提取流程的效率有待验证，部分公司的提取流程有待优化。
右一、右二两个数据来自国内企业生产的提取试剂盒，其表现力也不输Promega、Life、QIAamp等外企生产的提取试剂盒。
注：本次展示数据，不排除单次结果的数据偶然性。
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